Der Historiker
Sein Studium an der juristischen und wirtschaftswissenschaftlichen Fakultät der Universität Straßburg schloss François Wendel 1928 mit einer Diplomarbeit über das Heiratsrecht in Straßburg zur Zeit der Reformation ab, wodurch er bereits sein Interesse für die Geschichte religiöser Einrichtungen bekundete. Von 1930 bis 1938 war er Generalsekretär des Comité alsacien d’études et d’information [Elsässisches Komitee für Studien und Information] und von 1936 bis 1938 Generalsekretär der einflussreichen Société des Amis de l’Université de Strasbourg [Gesellschaft der Freunde der Straßburger Universität]. Diese Funktion versetzte ihn dazu in die Lage, während seiner verschiedentlichen Reisen durch Deutschland die Religionspolitik der Nationalsozialisten zu beobachten.
Seine Magisterarbeit über die Verfassung und Organisation der Straßburger Kirche entstand aus seinen Studien der Geschichte religiöser Einrichtungen. Aber er arbeitete auch über ideengeschichtliche Themen, wie seine Doktorarbeit Calvin, Sources et évolution de sa pensée religieuse [Calvin. Ursprünge und Entwicklung seines religiösen Denkens, 1946 ; Übersetzungen ins Englische und Deutsche] zeigt. Er versammelte auch ein internationales Komitee um sich, das sich der Übersetzung der Werke des Straßburger Reformators Martin Butzer widmete.
Der Akademiker
Parallel zu allen diesen Tätigkeiten nahm François Wendel ein Studium der protestantischen Theologie auf, das er mit dem Lizentiatendiplom abschloss. 1940 folgte er der Verlegung der Straßburger Universität nach Clermont-Ferrand, wo er 1942 zum Assistenzprofessor ernannt wurde. Nach der Rückkehr seiner Universität nach Straßburg erfolgte seine Promotion, und 1953 wurde er als Professor auf den Lehrstuhl für die Geschichte des Christentums berufen. Von 1958 bis 1967 war er außerdem Dekan der Theologischen Fakultät. In dieser Funktion setzte er sich für die Schaffung neuer Unterrichtformen ein und gründete das „Zentrum für Studien und pädagogische Praxis“ sowie ein weiteres Zentrum für Studien und Analyse der Werke der Kirchenväter.
Er war Mitglied des Akademischen Rats seiner Universität und leitete das Zentrum für Religionsgeschichte, eine gemeinsame Einrichtung des Historischen Instituts der Philosophischen Fakultät und der beiden theologischen Fakultäten.